Za mě: ,,Kdo jsi?" zeptal se.
vysvětlení: http://www.mo­jecestina.cz/ar­ticle/20140713­01-jak-psat-primou-rec

Upravil/a: quentos

Ptáte se na otázku, takže ani jedna varianta není správně.

Správně: „Kdo jsi?“ zeptal se

Pravidla pro interpunkci, když přímá řeč končí otazníkem, vykřičníkem nebo čárkou.

„Jak se máš?“ zeptala se mě sestra.
„Stůj!“ zvolal kamarád.
Dlouho jsem tě neviděla,“ usmála se na mne Eva.

Upravil/a: annas

Já myslím, že za a) tedy otázka i s otazníkem a potom malé písmeno.

Myslím, že a) je správně. Annas snad potvrdí.

Správně není ani jedno, ale a) je „nejblíže pravdě“ – akorát tam přebývá ta čárka.
Stačí otevřít kteroukoli beletristickou knihu a podívat se.

„Kdo jsi" zeptal se.
–
„Kdo jsi?" zeptal se.
Opr. Vypadl mi otazník. Chybička. 🙂

Upravil/a: marci1