Jsou tyto dva kroky totožné, vedou ke stejnému výsledku, nebo se liší?

Ano, je to tak, jak píšeš. Taky široce commander používám, ale přetahuju soubory. myší. Pomocí F6 jenom změníš umístění a nic nepřibude. Pokud jenom kopíruješ, vytvoříš duplikát a původní soubor můžeš (ale nemusíš) smazat. Samozřejmě se to hromadí v koši a zabírá místo na disku. Občas koš vysypu, a je to.

Pomocí F6 v TC fyzicky se soubory nic neděláš, data zůstavají na stejném místě na disku, pouze se přepíše jejch adresa v alokační tabulce (cesta k nim). Při kopírování F5 vytváříš kopii dat a když originál smažeš (a TC umožňuje možnost přímého mazání, tedy nepřesunutí do koše), tak to NENÍ to samé. Ovšem to platí pouze v rámci jednoho SVAZKU, při přesunu F6 mezi nimi už JDE o kopírování/ma­zání – rozdíl je v tom, že si ušetříš práci s mazáním.

BTW, ono ani přímé smazání data neodstraní, zůstanou na disku, pouze v alokační tabulce (FAT, MFT apod.) je prostor označen jako volný a existují utility, které takto smazaný a z koše vysypaný soubor umí obnovit. Kdysi umožňovala úplné smazání metoda „wipe“ [obvykle 25násobné přepsání náhodnými daty a následné smazání], bohužel dnes s ohledem na všelijaké indexace, náhledy, backy atd. NEVÍŠ kde všude může být nějaký nějaký datový zbytek. :(

Rychlejší je F6. Protože to jen přepíše tabulku. Druhý způsob vytvoří fyzickou kopii souboru.

Pokud ovšem půjde o různá fyzická média, je to úplně jendno. Přesto jedna klávesa a několik kláves je pořád rozdíl.

Nejsou totožné.
Totožné by byly, ve výsledku, kdyby jsi jako druhou možnost použil sekvenci F5, Ctrl+Del. I tak ti ale, dokud neprovedeš druhou operaci, budou soubory zabírat místo dvakrát.